El reto de comunicación del "Reporte de estado y tendencias de la biodiversidad continental de Colombia" está dado por la misión que la publicación tiene de darle información de alta calidad sobre el estado y tendencias de la biodiversidad al resto del país. Desde el 2014 inció una nueva línea de comunicación escrita y gráfica de la información, que además de la versión impresa también está disponible en línea, con el fin de realizar una comunicación efectiva a un público amplio. Aún existen retos que se deben abordar para alcanzar las metas establecidas, sobre todo en términos de evaluar el éxito comunicativo de esta publicación.