Protocolos de genómica para monitoreo ambiental asociado a acciones de respuesta por impacto o contingencia ambiental formalizados y listos para ser transferidos a usuarios interesados
Autor
Montoya Valencia, Paola
Franco-Sierra, Nicolás D.
González, María Claudia
Baena-Bejarano, Nathalie
Pulido-Santacruz, Paola
Salazar Villegas, Alejandro
Tovar Luque, Eduardo
Gonzalez, Mailyn
Fecha
2021-01-22Colecciones
Metadatos
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Resumen
En este documento se describen los aspectos más relevantes para aplicar la técnica de metabarcoding en estudios de biodiversidad. En la primera sección se realiza un recuento de los aspectos relevantes en el diseño experimental propios a la técnica. En la segunda se plantea una propuesta de protocolo para la aplicación del metabarcoding, incluyendo la toma de
muestra, el procesamiento molecular y el procesamiento o depuración bioinformática. El diseño de muestreo y los análisis ecológicos no son incluidos desde que estos son totalmente contexto-dependientes. En la tercera sección se describe un estudio de caso usando metabarcoding en la caracterización de microorganismos de una zona altamente contaminada por actividades
relacionadas a la extracción convencional de hidrocarburos. En la cuarta parte se realiza una revisión del potencial uso del metabarcoding en el monitoreo ambiental a través insectos. Finalmente, en la quinta y última parte se exponen algunas de las perspectivas y limitaciones del uso de la técnica en Colombia.
El objetivo de este documento es fomentar el uso de esta herramienta en escenarios colombianos, generando datos cuantitativos de diversidad que puedan ser incluidos en la toma de decisiones.
Palabras clave
MetabarcodingDiseño experimental
Protocolos para monitoreo
Hidrocarburos
Insectos
Estudio de caso
Diversidad
Editorial
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von HumboldtPrograma
Programa de Ciencias de la BiodiversidadEl ítem tiene asociados los siguientes archivos de licencia: